2019
1. 3月19日,中国科技大学蒋彬教授访问我们组并做了题为"气相-表面反应模拟:从直接动力学到神经网络高维反应势能面"的学术报告。
2. 3月27日,中国工程物理研究院化工材料研究所张朝阳教授访问我们组并做了题为"Moleclia Simulations on the Chemical Reactions of Energetic Materials(EMs) againest Thermal and Mechanical Stimuli"的学术报告。
3. 4月19日:宋宏伟副研究员访问重庆大学并做了题为"Quantum wave packet dynamics studies of gas-phase polyatomic molecular reactions and photo-dissociations"的学术报告。
4. 6月12日到6月14日,杨明晖,段谟杰,陈家文,宋宏伟,齐记等参加天津超算主持的国家重点研发计划"产学研用协同的高通量材料计算融合服务平台"项目讨论会。
5. 6月21日新加坡费莎医疗科技公司侯祖军博士访问我们组并做了题为"肿瘤功能影像组学"的学术报告。
6. 7月15日到7月17日,宋宏伟副研究员和张英峰参加天津超算主持的国家重点研发计划"产学研用协同的高通量材料计算融合服务平台"项目的讨论会。
7. 8月16日, 杨明晖研究员和宋宏伟副研究员分别获得国家自然科学基金面上项目资助。
8. 10月11日到10月14日, 宋宏伟副研究员、朱永发和田莉参加在苏州举行的第十六届全国动力学会议,朱永发和田莉同学分别做了墙报展示。
9. 10月18日:杨明晖研究员和宋宏伟副研究员访问了武汉纺织大学并分别做了题为"Machine Learning of the Rate Constants for the Reactions between Alkanes and Hydrogen/Oxygen Atom" 和"Development and Application of Machine Learning Method in Constructing Potential Energy Surfaces"的学术报告。
10. 10月21日到10月25日,杨明晖研究员、宋宏伟副研究员和齐记博士参加在昆明举行的第三届材料基因工程高层论坛。杨明晖研究员做了邀请报告。
2018年
1. 03月29日-03月30日,中国工程物理研究院张朝阳研究院来访,并作"Tale of A Novel Energetic Material of TKX-50"的学术报告。
2. 04月20日-04月21日, 郑利敏副研究员及陈家文副研究员参加湖北省暨武汉生物物理学会2018学术会议,陈家文副研究员作"钙黏蛋白在细胞膜上结合动力学的模拟研究"的口头报告,郑利敏副研究员做题为"用高斯密度模型研究金属离子的极化和电荷转移现象"的学术报告。
3. 04月26日, 杨明晖研究员参加"NVIDIA GPU加速AI &HPC"武汉站活动,并作题为"GPU在计算化学中的应用"的口头报告。
4. 04月26日, 齐记,张英峰,张慧敏参加"NVIDIA GPU加速AI &HPC"武汉站活动。
5. 05月1日-05月3日, 杨明晖研究员访问华东师范大学张增辉教授研究组,做学术报告"脂肪酸结合蛋白(FABP)结合机制的分子动力学模拟"。
6. 05月4日-05月9日, 郑利敏副研究员,段谟杰副研究员,宋宏伟副研究员,陈家文副研究员及齐记博士参加中国化学会第31届学术年会,段谟杰副研究员作"固有无序蛋白结构系综及其构象转化的计算模拟"的口头报告,宋宏伟副研究员做题为"理解化学反应模式选择性:正则模式与局域模式"的口头报告,郑利敏副研究员做题为"用高斯密度模型研究金属离子的极化和电荷转移现象"的墙报展示,陈家文副研究员做"柔性蛋白的结合动力学的模拟研究"墙报展示,齐记博士的墙报"Quantum Chemistry software WESP on CPU-GPU hybrid computers"展示获CJCP优秀墙报奖。
7. 05月23日, 陈家文副研究员参加第八届国家重点实验室协同创新研讨会。
8. 05月27日, 齐记、施凡分别进行研究生毕业论文答辩,齐记的博士毕业论文题目是"基元反应的量子动力学理论研究",施凡的硕士论文题目是"基于神经网络构建小分子势能面"。
9. 05月28日-05月29日, 四川大学杨明理教授来访,并作"生物医用材料基因工程研究"的学术报告。
10. 05月30日, 刘娜、孙勇进行博士毕业论文答辩,刘娜的博士论文题目是"固有无序蛋白结构和动力学的全原子分子动力学模拟",孙勇的博士论文题目是"复杂电网同步稳定性研究:从少体到多体"。
11. 06月03日,课题组成员在东湖绿道进行研究生户外拓展活动。
12. 06月05日,郭玥、朱永发被评为"三好学生"。
13. 06月07日,华中科技大学余昊教授来访,并作"Hidden dynamics in the unfolding of individual membrane proteins"的学术报告。
14. 07月18日,西澳大学的Prof. Amir Karton 来访,并作题为"A computational chemist´s guide to accurate thermochemistry for organic molecules"的学术报告。
15. 7月24日, 河南科技大学物理工程学院张大为教授来访,并作为题为"PSBC model and its application in the folding of α-helices and β-sheets"的学术报告。
16. 7月,宋宏伟副研究员获研究所优秀共产党员。
17. 加利福尼亚大学戴维斯分校段勇教授2018年7月中旬-2018年9月初来访并合作研究。
18. 2018.8.23-24,杨明晖研究员参加2018材料基因组重大研究计划启动会。
19. 2018.9.8-2018.9.11,杨明晖研究员,段谟杰副研究员,宋宏伟副研究员及齐记博士赴国家超级计算天津中心参加国家重点研发计划"产学研用协同的高通量材料计算融合服务平台"项目启动会。
20. 2018.10.10-10.14,杨明晖研究员,段谟杰副研究员,郭玥及王可同学参加第20届全国波谱学学术会议。段谟杰副研究员作"固有无序蛋白结构及其结合机制的计算模拟"的口头报告,郭玥,王可分别做"心脏脂肪酸绑定蛋白(H-FABP)绑定机制的分子动力学模拟"及"温度副本交换方法用于研究磷酸化调控4E-BP2蛋白结构的机制"的墙报展示。
21. 2018.10.15-16,杨明晖研究员参加第二届材料基因组高层论坛。
22. 2018.10.27,课题组成员在木兰胜天农庄进行研究生户外拓展活动。
23. 2018.11.20-2018.11.22,杨明晖研究员与齐记博士赴苏州参加GTC China 2018会议。
24. 2018.12.8,杨明晖研究员受邀参加中原工学院弘德论坛,并做题为"GPU在分子模拟中的应用"的邀请报告。
25. 2018.12.10-14,杨明晖研究员参加清华三亚国际数学论坛,参加"Computational and Mathematical Approaches for Bioinformatics and Biophysics"讨论会。
2017年
1. 2月25日,墨尔本皇家理工大学和SRD生物科技有限公司(Royal Melbourne Institute of Technology,SRD Biosciences Co. Ltd)曾军博士应邀来所访问,并作题为“Field-theoretical method and epsilon-expansion in meta-stable quantum systems”的学术报告。
2. 3月16日,宋宏伟副研究员获2016年度物数明星之“量子动力学之星”。
3. 3月22日,华中师范大学化学学院万坚教授应邀来所访问,并作题为“DOX 预测生物大分子与配体结合构象研究的新进展”的学术报告。
4. 5月26日,美国密歇根大学(Michigan State University,USA),魏国卫教授应邀来所访问,并作题为“Mathematical deep learning prediction of biomolecular properties”的学术报告
5. 5月19 日,课题组成员在仙桃沙湖清风马场进行研究生户外拓展活动。
6. 6月7日- 6月12日,组内全体成员前往大连参加由辽宁师范大学承办的第十三届全国量子化学会议,杨明晖研究员作题为“H+CH4→H2+CH3十维量子动力学理论研究”邀请报告,宋宏伟副研究员作题为“五原子反应的全维动力学研究”口头报告,全组共提交墙报5篇,齐记获大会优秀墙报奖。
7. 6月21号宋宏伟副研究员访问上海大学理学院量子与分子国际中心,并做了题为“量子波包方法及其在五原子体系中的应用:反应动力学与光谱”的学术报告。
8. 6月23日-6月26日,段谟杰副研究员参加北京大学举办的Quantitative Biology: Computational and Single-Molecule Biophysics会议,并做了题为:"Structural Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins (IDPs) Determined by Enhanced Sampling and NMR Restraints" 的报告。
9. 7月12日,美国爱因斯坦医学院(Albert Einstein College of Medicine)陈家文博士应邀来所访问,并作题为“Understand the influence of E-cadherin clustering on its biological function using multi-scale model”的学术报告。
10. 7月13日,朱永发,苏昕玥参加中科院武汉物数所2017年天眷学子硕士学术论坛,朱永发墙报题目为 ”Quasi-Classical Trajectory Study of the OH+H2O→H2O
+OH Reaction on a New ab Initio Based Potential Energy Surface”,苏昕玥墙报题目为“固有无序蛋白结构系综的计算模拟”。
11. 7月17日-7月18日,复旦大学王文宁教授来访,并作 ”Probing Protein Conformational Dynamics by Combining Experimental and Computational Studies“ 的学术报告。
12. 8月11-14号,宋宏伟副研究员等4名组内成员参加在西安举行的2017分子反应动力学基础问题研讨会,并做了题为“量子分子反应动力学理论”的专题报告。
13. 8月15-17日,杨明晖研究员、段谟杰副研究员参加在长春举行的波谱与原子分子物理国家重点实验室、化学生物传感与计量学国家重点实验室、生命分析化学国家重点实验室、电分析化学国家重点实验室四个国家重点实验室的学术交流会。
14. 8月18-8月22日,杨明晖研究员,宋宏伟副研究员,郑利敏副研究员,朱永发,平磊磊五人前往南京参加第十五届全国化学动力学会议,杨明晖研究员做题为“H+NH3→H2+NH2反应中的NH3振动简并态”的邀请报告。
15. 8月19号,杨明晖研究员和段谟杰副研究员分别获得国家自然科学基金面上项目资助。
16. 9月4日,2017级硕士生张慧敏,田莉,王可加入理论与计算化学研究组,朱永发硕转博成为2017年博士生。
17. 9月5日- 9月7日,齐记前往北京参加2017人工智能计算大会。
18. 9月17日,苏昕玥获得2017年华夏幸福北京马拉松25-29岁年龄组第120名。
19. 10月19日,我组博士生刘娜同学和硕士生张英峰同学荣获2017年所奖学金。
20. 10月20-22日,郑利敏副研究员参加在西南交通大学峨眉校区举办的2017年物理与材料科学前沿论坛。
21. 10月23日,华东师范大学、纽约大学(New York University)张增辉教授应邀来所访问,并作题为“趋近于实验精度的蛋白-配体结合自由能的理论计算预测”的学术报告。
22. 10月25日-12月2日,重庆大学李军课题组的卢丹丹同学来理论与计算化学研究组学习。
23. 11月5日,课题组成员在京山美人谷进行研究生户外拓展活动。
24. 11月12号,苏昕玥同学获得2017年武汉女子半程马拉松第77名。
25. 11月17日-11月20日,段谟杰副研究员参加南京大学举办的 第十四届全国计算(机)化学学术会议,并做了题为“The Ligands Induced Allosteric Effects on Androgen Receptor (AR) Studied by Molecular Dynamics Simulations”的学术报告。
26. 11月21-23日,杨明晖研究员应邀和宋宏伟副研究员参加在广州召开的“第一届材料基因组工程高级论坛”学术会议。
27. 12月1日,陈家文副研究员加入理论与计算化学研究组。
28. 12月21 -12月22日,齐记,刘娜,郭玥,朱永发,苏昕玥参加由武汉光电国家研究中心举办的联合研究生学术年会。
29. 12月29日,刘娜通过博士中期考核,郭玥、朱永发通过博士开题,张英峰通过硕士开题。
2016年
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宋宏伟,多原子分子体系光电子-光解碎片符合谱的理论研究,国家自然科学基金青年基金[21603266],2017.01-2019.12,21万元。
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第七届海峡两岸理论与计算化学会议,Mode-specific SN2 Reaction Dynamics,杨明晖,邀请报告,长沙
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中国化学会第30届学术年会,成像高维多通道势能面:光致脱附负离子H-(NH3)和NH4-,宋宏伟,分会报告,2016.07.01-2016.07.06,大连
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2016年湖北省生物物理年学术会议,细胞膜中人类胰岛淀粉样多态聚集机制的计算研究,段谟杰,大会报告,2016.04.16-2016.04.17,孝感
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2016级硕士张英峰同学加入理论与计算化学研究组。
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刘瑞同学完成了她的博士学位答辩,答辩题目"X+CH4反应的高维动力学研究"
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陈柳杨同学完成了他的硕士学位答辩,答辩题目"构建多维化学反应势能面新方法"
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齐记获校三好学生称号; 齐记获2016年学业奖学金一等奖;
- 施凡获我所2016年天眷学子硕士学术论坛暨第一届"东湖论坛"优秀墙报奖;
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刘娜获物数明星"学子之星"
2015年
8. 11月13日,宋宏伟副研究员加入理论与计算化学研究组。
7. 10月20日,王艳的文章"Mode specific dynamics of the H2 + CH3→H + CH4 reaction studied using quasiclassical trajectory and
eight-dimensional quantum dynamics methods" 发表。J. Chem. Phys., 143, 154307 (2015)
6. 10月19日,郑锐的文章" Theoretical studies for the N2–N2O van der Waals complex: The potential energy surface,
intermolecular vibrations, and rotational transition frequencies" 发表。 J. Chem. Phys., 143, 154304 (2015)
5. 10月1日,刘娜同学的文章"An eight-dimensional quantum dynamics study of the Cl + CH4→ HCl + CH3 reaction" 发表。
J.Chem. Phys., 143, 134305 (2015)
4. 10月1日, 段谟杰副研究员的文章" Network representation of conformational transitions between hidden intermediates of Rd-
apocytochrome b 562" 发表。J. Chem. Phys., 143, 135101 (2015)
3. 9月1日,杜桃园,朱永发, 李木子, 王新强,平磊磊,苏昕玥加入理论与计算化学研究组。
2. 8月21-24日,杨明晖研究员,齐记,刘瑞,刘娜,施凡五人前往西安参加第十四届全国化学动力学会议,该会由陕西师范大学主办。
1. 6月2日-6日, 杨明晖研究员,刘瑞,刘娜三人前往大连参加第十五届量子化学国际会议卫星分会"小分子体系动力学理论研讨会",该会
由大连化学物理研究所承办。
2014年
11. 11月11日-11月18日,新加坡南洋理工大学张大为助理研究员受邀访问理论与计算化学组,并做题为“Application of Polarized Charge Model In Molecular Dynamics Simulation”的报告。
10. 10月16日-10月28日,西北大学文振翼教授来访理论与计算化学组,并讲授电子结构基本理论及他们最近发展的电子相关方法和软件。
9. 10月16日-10月17日,西北大学索兵兵副教授来访理论与计算化学组,并讲解软件的安装及使用。
8. 9月24日,王艳同学完成了她的博士学位答辩,答辩题目:1,8-萘酰亚胺类荧光探针分子光物理过程的理论研究。
7. 9月1日,热烈欢迎齐记,2014级硕士施凡同学加入理论化学计算研究组。
6. 8月3日到8月8日,杨明晖研究员、郑利敏、王艳、刘瑞和刘娜一行5人去北京参加中国化学会第二十九届学术年会,该会由北京大学主办。
5. 8月1日,段谟杰副研究员加入理论计算化学组。
4. 7月25日,郑锐博士加入理论计算化学组。
3. 6月29日至7月11日,郑利敏和陈柳杨到中科院大连化学与物理研究所张东辉组学习,他们主要学习用神经网络方法构建势能面。
2. 6月12日至6月15日,杨明晖研究员、郑利敏、王艳、刘瑞、陈柳杨和刘娜六人去太原参加第十二届全国量子化学会议,该会由山西师
范大学主办。
1. 5月20日,高恺夫同学完成了博士学位答辩,答辩的题目为:HPPK 蛋白酶构象变化以及螺旋束蛋白折叠新方案的分子动力学模究。
2013年
16. | 12月6日,在读博士研究生刘瑞同学荣获2013年研究生国家奖学金。同日,刘瑞同学参加中国科学院生物磁共振分析重点实验室的第一届Poster Day活动,并荣获优秀poster三等奖。 | |
15. | 11月22日,受武汉物理与数学研究所所长刘买利研究员和理论与计算化学组组长杨明晖研究员的邀请,北京师范大学化学学院方维海教授来访,并做题为"Ab initio based non-adiabatic dynamics simulation on IC and ISC processes: a case of acrolein in the gas phase and aqueous solution"的学术报告。随访人员还有北京师范大学化学学院的刘亚军教授和陈雪波博士,他们分别做了题为Bioluminescence in Silico"和"Luminescence Mechanism of WOLED Materials and Fluorescent sensors"的学术报告。 | |
14. | 11月17日至11月21日,郑利敏和王艳同学去上海参加2013年计算科学国家会议(the International Symposium on Computational Sciences (ISCS2013)). | |
13. | 10月26日,美国Michigan State University的严宏高教授访问理论与计算化学组。 | |
12. | 9月29日,戴伟博士顺利通过博士后出站答辩。 | |
11. | 9月1日,2013级硕士研究生刘娜同学加入理论与计算化学组。 | |
10. | 8月23日至8月26日,杨明晖研究员、郑利敏和刘瑞三人去芜湖参加第13届全国化学动力学会议。该会由安徽师范大学承办。 | |
9.
| 8月21日,杨明晖研究员的国家自然科学基金面上项目"X+CH4反应模式选择性的高维量子动力学研究"获得批准资助,资助金额为80万元;郑利敏助理研究员的国家自然科学基金青年基金项目"CO2家族分子构成的范德华复合物振转光谱的理论研究"获得批准资助,资助金额为25万元。 | |
8. | 7月23日,高恺夫同学荣获中国科学院大学2012-2013学年"三好学生"荣誉称号;刘瑞同学荣获中国科学院大学2012-2013学年"三好学生标兵"荣誉称号。 | |
7. | 5月28日,刘瑞同学的文章"Mode Selectivity in Methane Dissociative Chemisorption on Ni(111)"被Chemical Science接收。 | |
6. | 5月27日,杨洋与付红两位同学完成博士学位论文答辩。 | |
5.
| 5月5日,与华中师范大学万坚教授组合作文章"Understanding the electronic energy transfer pathways in the trimeric and hexameric aggregation state of cyanobacteria phycocyanin within the framework of forster theory"发表。Journal of Computational Chemistry, 34(12), 1005-1012, 2013. DOI: 10.1002/jcc.23221. | |
4.
| 4月,付红同学的文章"Accelerating modified Shepard interpolated potential energy calculations using graphics processing units"发表。Computer Physics Communications, 184(4), 1150-1154, 2013. DOI: 10.1016/j.cpc.2012.12.005. | |
3.
| 3月28日,与新加坡南洋理工大学合作文章"Full-dimensional quantum calculations of the vibrational states of H5+ "发表。Journal of Chemical Physics, 138(12), 124309, 2013. DOI: 10.1063/1.4797464. | |
2.
| 1月28日,郑利敏助理研究员的文章"Theoretical studies of the CO2-N2O van der Waals complex: Ab initio potential energy surface, intermolecular vibrations, and rotational transition frequencies" 发表。Journal of Chemical Physics, 138(4), 044302, 2013. DOI: 10.1063/1.4776183. | |
1.
| 1月3日,与新墨西哥大学郭华教授的合作文章"Ring Polymer Molecular Dynamics Calculations of Thermal Rate Constants for the O(P3) + CH4 -> OH + CH3 Reaction: Contributions of Quantum Effects"发表。Journal of Physical Chemistry Letters, 4(1), 48-52, 2013. DOI: 10.1021/jz3019513. | |